El GeoMx® Cancer Transcriptome Atlas (CTA) está diseñado para un análisis completo de la biología del tumor, el microambiente tumoral y la respuesta inmune, con una resolución espacial, a partir de distintas regiones de interés seleccionadas en un único corte de tejido.
Este panel posibilita el análisis de la expresión de unos 1800 genes, cubriendo unas 100 rutas distintas, y le permite:
- Estudiar la respuesta inmune ante el tumor
- Analizar el microambiente tumoral
- Cuantificar la reactividad del tumor a la respuesta inmune y a los tratamientos
- Realizar el perfil de tumores heterogéneos, cubriendo conjuntos de genes relevantes clínicamente (Tumor Inflammation Signature (TIS), PAM50…)
Además, se puede personalizar con hasta 60 dianas de interés adicionales.
El GeoMx® CTA es compatible con la tecnología RNAscope® y con anticuerpos para el marcaje morfológico que posibilitan la selección de las regiones de interés en el tejido.
La lectura se realiza mediante secuenciación masiva (NGS), y dispone del software GeoMx DSP data center, una solución bioinformática integral que le permitirá desde la selección de las regiones de interés (ROIs) y la toma de imágenes, hasta un análisis de datos totalmente integrado.