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El panel FusionPlex® Lung v2 es un producto de secuenciación masiva o NGS para investigación que amplía el contenido del panel FusionPlex® Lung para potenciar nuevos descubrimientos. El diseño actualizado cubre puntos de rotura implicados en fusiones publicadas recientemente e isoformas de interés en genes clave (incluyendo los NTRKs). Además, sigue las directrices existentes para la investigación del cáncer de pulmón de células no pequeñas, incluyendo NCCN y ESMO (ESCAT).
La línea FusionPlex® utiliza ARN en vez de ADN como material de partida, lo cual permite una detección de las fusiones más precisa y rentable que las técnicas de captura híbrida basadas en ADN. Los cebadores específicos se sitúan cerca de puntos de rotura conocidos implicados en fusiones para identificar anomalías en el ARN con un solo cebador. Dado que la línea FusionPlex® permite identificar tanto alteraciones conocidas como nuevas con un número limitado de cebadores, es posible detectar fusiones de forma más eficiente y precisa que los enfoques basados en el ADN.
Todo el contenido génico del panel Lung v1 está cubierto en la v2, incluyendo eventos de skipping u omisión del exón 14 de EGFR vIII y MET, junto con destacadas fusiones de ALK, BRAF, FGFR, NRG1, NTRK, RET y ROS1 y mutaciones puntuales seleccionadas.
El panel está potenciado por la química de enriquecimiento Anchored Multiplex PCR (AMP™) para detectar fusiones en un único producto de secuenciación, incluso sin conocimiento previo de los genes de la fusión o los puntos de rotura.
El análisis e interpretación de resultados se realiza con el software específico Archer Analysis.
Detección exhaustiva de las fusiones
La química AMP™ utiliza la amplificación dirigida de final abierto para identificar las fusiones de genes, se conozca o no la pareja de fusión.
Variantes de splicing
Detectar isoformas y eventos de splicing alternativo asociados al cáncer.
Muestras complicadas
Diseñado especialmente para una amplia compatibilidad con diversos tipos de muestra, incluidas las muestras degradadas y de bajo rendimiento, como el tejido FFPE.
Flujo de trabajo sencillo y reactivos liofilizados
Reactivos liofilizados fáciles de utilizar y flujo de trabajo sencillo para minimizar los errores y reducir tiempos.
| Genes diana | 17 |
| Cantidad de ácidos nucleicos necesaria* | ≥10 ng |
| % mapeado On-target | >96% |
| Tipos de muestra | Frescas, congeladas y FFPE |
| Tiempo de preparación manual | 3,5 horas |
| Tiempo total | 1,5 días |
| Plataformas | Illumina® e Ion Torrent™ |
| Producto | Referencia |
|---|---|
| Kit FusionPlex® Lung v2 Kit, para Illumina®- 8 reacciones | AB0135 |
| Kit FusionPlex® Lung, para Illumina®- 8 reacciones | AB0121 |
| Kit FusionPlex® Lung, para Illumina® - 48 reacciones | AB0129 |
